Opistoa ylläpitää Korpisaaren säätiö, ja sen ylintä päätösvaltaa käyttää 18-jäseninen hallintoneuvosto. Hallintoneuvosto valitsee opiston hallituksen, johon kuuluu yhdeksän jäsentä. Hallintokausi on sekä hallintoneuvostossa että hallituksessa kolmen vuoden pituinen.
Korpisaaren säätiön toimitusjohtajana on rehtori Kyösti Nyyssölä, joka toimii sekä hallintoneuvoston että hallituksen esittelijänä ja sihteerinä.
Hallintoneuvoston jäsenet
Aro Jorma, kulttuurineuvos
Autio Johanna, toiminnanjohtaja
Koivuniemi Tuomas, päätoimittaja
Korpela Sami, asiantuntija
Koskela Harri, yrittäjä
Lähdesmäki Juhana, Ilmajoen kunta
Marjamäki Lari, kasvatus- ja opetusjohtaja
Mäki-Latvala Elina, emäntä
Mäkinen Jaakko, nuorisotyöaineiden opettaja
Männistö Elisa, luonnontieteiden opettaja
Peräaho Heikki, yrittäjä
Perälä Kirsi, lakimies
Puotinen Lea, vararehtori
Ranto Ahti, maanviljelijä
Risikko Paula, kansanedustaja
Savola Mikko, kansanedustaja
Sihto Paula, terveydenhuoltoneuvos
Takala Antti, sivistys- ja hyvinvointijohtaja
Vihriälä Jukka, valtiopäiväneuvos
Ylisiurua-Hemminki Satu, lakiasiainjohtaja
Hallintoneuvoston puheenjohtajana toimii Jukka Vihriälä ja varapuheenjohtajana Kirsi Perälä. Kokouksiin osallistuu myös Korpisaaren säätiön hallituksen puheenjohtaja.
Hallituksen jäsenet
Ala-Ilkka Jaakko, kiinteistöpäällikkö
Autio Johanna, toiminnanjohtaja
Kivimäki Rauno, työvoimaneuvoja
Lähdesmäki Merja, tutkija, tohtori
Pihlajaviita Seija, laatujohtaja
Päkkilä Teijo, rehtori
Tuomikoski Timo, ekonomi
Virkkala Mika, maakuntarahastojohtaja
Yli-Ojanperä Kirsti, vammaispalveluiden koordinaattori
Säätiön hallituksen puheenjohtajana toimii Sami Kurki ja varapuheenjohtajana Jaakko Ala-Ilkka. Kokouksiin osallistuvat myös vararehtori Minna Kansanaho, Korpisaaren säätiön hallintoneuvoston puheenjohtaja Jukka Vihriälä sekä varapuheenjohtaja Kirsi Perälä.